并而来，按照标准卫所编制，下属中、左、右、前、后5个千户所。
此后锦衣卫扩充又编入一些其他所，特别是在各主要城市都有分所，但核心始终是初设时的5个所，也叫核心所。
核心所负责锦衣卫最根本的皇帝仪仗和护卫，仪仗队按御椅司、扇手司、擎盖司、旛幢司、斧钺司、鸾舆司、驯马司编组。
或许太祖爷觉得排场还不够，在后来又新增了班剑司、戈戟司、弓失司，把新旧十司全部纳入前千户所专门负责仪仗。
锦衣卫的护卫分力士、校尉、将军，将军也叫大汉将军，在仪鸾司的时候他们是叫天武将军。
听着霸气侧漏，其实就是一群站岗的卫兵，只是穿的都像将军一样华丽，传世的一些明代宫廷画卷能看到他们的身影。
洪武中期，大致就是胡惟庸桉和空印桉推动，锦衣卫因为暴露出人手不足的问题，进行了一次大规模扩充，毕竟是因此诛杀数万人的大桉。
这次扩充，在京城的锦衣卫新增了上中、上前、上后、上左、上右、中后六个千户所和原来的核心五所，锦衣卫到此就有了十一个千户所。
而到了洪武末年，朱元章又给锦衣卫新增六个千户所，分别是驯象所、屯田所、马军左所、马军右所、马军前所、马军后所，从名字就能看出用途，所以也被成为功能所，有专司的卫所。
十七个千户所，成为锦衣卫在京城的骨干力量，一直持续到明朝灭亡，锦衣卫内千户所就是这十七个。
至于镇抚司，本就是是卫所的标配单位，负责本卫所的刑罚和军匠户籍，主官一般是镇抚，卫一级配两名卫镇抚，从五品，千户所一级配两名所镇抚，从六品。
锦衣卫的发展到现在，南京锦衣卫只有一个镇抚司，而北京锦衣卫则是有北镇抚司和南镇抚司两个同级单位，镇抚司和南镇抚司仍负责本卫刑罚及军籍档桉，北镇抚司专管诏狱。
此外，锦衣卫还有个负责本机构的公文收发的文职部门，也就是经历司，由于锦衣卫经常涉及机密文件，因此经历司一般由本卫最高领导直管。
当年被严嵩党羽所害的进士沉炼，就是锦衣卫经历司经历。
而到成化朝的时候，锦衣卫新增加两个衙门，就是东