闽地，鲁王义军四起，声势虽大，可大部分的义军皆是甲械不全，持锄头，铁叉者不可计数。
昔日杭州总督张存仁，此时已被多尔衮加封为福建总督，义军四起的现象虽让李成栋，金声恒二人四处奔波，可只要清兵一至，几乎无可敌者，渐渐的，在张存仁的恩威并施下，闽地士绅逐渐归顺，数月时光，福建义军渐息，而李成栋更是突袭厦门，随着郑彩被杀，鲁王奔之南澳岛，投奔郑成功，福建已逐渐安定。
张存仁缺少水师，虽然张存仁在泉州莆田等地组建水师，可一经汇集，便被郑成功率部摧毁，张存仁见在闽地组建水师无望，便将目光聚焦在广东的邵武朝廷上！
此时的郑成功已经汇集旧部三万余人，战船近千条，而郑成功见福建清军势大，决定收复台湾，以安置士卒家眷。
…………
在四川，大西军出川后，与豪格，吴三桂连续大战数十场，却败多胜少。
而张献忠接连遭遇失败，战局十分不妙，西军节节败退，同时后方明朝参将杨展趁机反攻。
西军两面受敌，杨展领兵夺川南州县，率师北上，与西军的激战于彭山的江口，败西军，杨展由南面逼向成都，同时豪格率清军又攻克汉中，进逼川中，四川的北大门已然洞开。
张献忠怒不可遏，决定放弃成都，张献忠率部离开成都，北上迎击清军。
张献忠集兵二十万余，进驻西充凤凰山，可由于部下刘进忠出卖，引清军自汉中出巴裕关，折向西行沿东河谷地到达南部及西充，对西军所在凤凰山进行了突然袭击。
清兵猝至，疏于防备的张献忠猝不及防，西军虽被突袭，却尚能勉强维持，可不知何处飞来一支流矢，正正射中张献忠，主帅生死不知，西军人心惶惶，在清军突袭下西军随即大败。
张可望，张定国，张文秀，张能奇四个义子，急托扶张献忠撤离，张献忠临死前，他对四个义子说道：“明廷三百年正统，未必遽绝，亦天意也。我死，尔急归明，毋为不义”。
随后四人草草安葬张献忠后，率部南下，归降永历帝。
而永历帝收到西军决定投降的消息，泪流满面，这个时候的永历君臣再没有历史上对西军不屑一顾，朝堂上下说怪话的场景