—人，“比中夏相国”（《周书》卷50《高昌传》），很可能兼理高昌郡事，相当于丞们兼京兆尹。令尹之下，文官系统在麴氏王朝末期，分为八部，即：吏、祠、库、仓、主客、礼、民、兵部。每部置长史一人为正长官，司马一人为副长官。八部下，置侍郎、校书郎、主簿、从事等官吏，“阶位相次，分掌诸事”；此外，还置“省事”，专门负责“导引”（《周书》卷50《高昌传》）。高昌是个高度君主集权的王国。军国大事，几乎全部由国王专断（甚至民间土地所有权的转让，也由国主决定）；在国王周围也有一个很小范围的决策机构，“由世子（很可能即兼令尹）及（交河、田地）二公”组成，日常事务，由他们“随状断决”（《周书》卷50《高昌传》）。王廷诸官，属于行政官员，“虽有列位，并无曹府”，每天清晨诸官上朝，“集于牙门评议众事”（《周书》卷50《高昌传》）。官虽多而衙门少，事务性质的工作，办起来到也集中、迅速。
高昌国和中原一样，也实行郡县制。据黄文弼考证，其大城有五，即高昌、田地、交河、蒲昌和天山城；并且倾向于五城即五郡。由于解放后大量吐鲁番文书的出土，经研究，高昌麴氏王朝后期，有都城一高昌城；郡城三：交河、田地和南平城（新疆吐鲁番县城南40里的让布工商古城，俗名“拉木伯”）；县城十四：横截、永昌、无半、始昌、安乐、安昌、永安、洿林、高宁、宁戎、威神、临川、酒泉、龙泉城；镇戍四：东镇城、笃进、盐城和柳婆城。总计二十二城。《周书·高昌传》说：“诸城各有户曹、水曹、田曹”，每城由国王派遣司马、侍郎相监检校，名为“城令”。
法律制度
有关法律制度，《北史》和《周书》都只提到，其刑法“与华夏小异而大同”。根据高昌章和十一年（541年）都官文书，王国中央有都官部负责刑律，其长官是都官长史麴顺。为了翟忠义其人有一个奴隶逃亡，国王麴坚亲自下令，要都官部行文郡县，进行追捕，都官部的文书是直接下达给交河郡以及柳婆、无半、盐城、始昌4县“司马主者”的。说明其司法系统是都官、郡司马、县司马。
财政制度
财政制度方面，《北史》只提到“赋税则计田输银钱，无者输麻布”。从解放后出