臣以为应该限定在军事机密事务，寻常的军事事务则不必这样。”
朱由检听着这番言论，又冒出一个想法，说道：
“韩卿此言甚好！”
“朕之前就让通政司成立公文处，并且让锦衣卫保密司入驻，负责军情机密和银章密奏事宜。”
“现在看来，应该更进一步，在公文处下面成立军机科，专门负责军事机密类奏疏。”
“其它财政、礼法、藩属等事务，也应专门分科。”
“选择可靠人员，去通政司任职。”
这个提议说出，通政使吕图南眼前一亮。
要说这次五院调整中最受伤的是谁，那是非他莫属了。
原本通政使和大理寺卿排在九卿最后，级别同是正三品。通政使地位还高一点，稍微高于大理寺卿。
结果这次五院调整中，通政司丝毫没变化，甚至没有和六部等衙门并入政务院。
大理寺却摇身一变，成为了五院之一的大理院。
虽然在五院中排行第四，和政务院、枢密院这东西二府不能比。但是大理寺的官职，却实实在在提升了品级。大理寺的官员，也有了更高的提升空间。
与之对比，通政司职官几乎没有变化。只有杨嗣昌凭借个人能力，被调入了枢密院。
尤其是曾经归属通政司的六科，这次被划给了大理院。吕图南这个通政使，对此实在很伤心。
现在，他这个通政使不但排在九卿最末，甚至有声音冒出：说通政使这个正三品官职撑不起九卿的名号，应该把九卿的称呼，让给同属五院的理藩院掌院。
如今皇帝终于想到通政司，这让他有些激动地道：
“臣以为科级实在太低，应该把公文处提升为公文厅，下设军机处、财政处、礼法处、藩属处等处，分管相应奏疏。”
“将来奏疏到达通政司后，由公文厅处理，送给分管的大学士。”
这样一个流程，和以前相差不大，但是通政司却多了一个分类权。下面也增加了一些机构，能让通政司的官员稍有慰藉。
朱由检点头认可，觉得这有利于自己给大学士分工，而且没有给内阁增加僚属，没扩展内阁的权力。