好在这两个部现在也没多少事务，协理院事的孔贞运，完全能照顾过来。
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命令下达之后，孔贞运很快和琉球使者商谈内附之事。
琉球使者听到这个消息后，可谓惊喜交集。
事实上，琉球受萨摩藩的侵扰，远比他向孔贞运透露的严重。
琉球早在二十年前就被萨摩藩击败，被迫向其朝贡。琉球国王人选，都要受萨摩藩主干涉。
这些他以前不敢说，如今在听到大明有意让琉球内附后，才哭着道了出来。请大明主持公道，把琉球从萨摩藩解救出来。
孔贞运听到这些，一时义愤填膺。
他实在没有想到日本的胆子这么大，区区一个萨摩藩，就让琉球朝贡。甚至连琉球国王的人选，都有胆量干涉。
这是对宗藩关系的极大破坏，大明若不拿出态度，如何还维持天下秩序。
所以他很快就带着琉球使者觐见皇帝，说明这个新情况。请求海军出兵，帮琉球驱逐萨摩藩。
朱由检听闻此事，同样极为生气。
但是他这时对日本的怒气已经压了下去，听从孔贞运的劝谏把精力用于建虏。
所以在思索之后，没答应孔贞运发兵的请求，而是下达命令道：
“郑芝龙不是想要出兵吗？”
“朕就如他所愿，让他出兵琉球，完全驱逐萨摩藩。”
“若是成功，朕允许他择取一个岛屿做领主，多封一个子爵。”
“其他人若有立功者，同样可封爵位。”
把这件事交给了郑芝龙，打算靠他的力量驱逐萨摩藩。
至于所谓的付出，则是子男爵位，同时把郑家的力量，放在琉球牵制本土势力。
对琉球国王的册封，同样也定了下来。
因为此时的琉球国王太弱势，还需要大明帮助，所以侯爵是没有的，只能被册封为伯爵。
以后的外藩琉球王国，就变成了内藩琉球伯国。由福建巡抚监管，并且由朝廷派长史。
琉球内部也要进行改造，符合大明制度，使用大明的文字和语言。
朱由检让孔贞运以琉球为试点，摸索如何把外藩改为内藩。