时已晚，总督还是被毒死了。
有巡逻的士兵发现了艾吉奥，又看到了被毒死的总督，直接就将他给当成了凶手。
整个威尼斯都在通缉艾吉奥，圣殿骑士的计划算是成功了，换了他们扶持的总督上位。
在新总督的命令下，威尼斯全方位的开始打压刺客组织，艾吉奥一度都出不了门，外面的搜查不是一般的严格。
任何带着连兜帽的人都会被强制掀开，城里遍布着艾吉奥和川上富江的通缉令。
游戏里，艾吉奥还是成功的干掉了新上任的威尼斯总督，可这一次，他没机会了。
一切的防备措施都是出自影卫之手，他现在成了意大利圣殿骑士团的二把手，罗德里戈忙着争夺教皇之位的时候，管理圣殿骑士团的就是影卫。
影卫的野心不止一个小小的威尼斯，而是想借此将整个意大利都给拿下，换上圣殿骑士团扶持的人上位。
威尼斯只是第一步，之后还有很多意大利重要的城市，那些总督同意成为圣殿骑士团的一员，他们就可以活，否则就死。
艾吉奥一直躲藏在盗贼工会里面，都有些心灰意冷了。
不是不想努力，而是真的拼不起。
这边刚刚出门想要有点动作，那边威尼斯的正规军就杀过来了。
每一个士兵都配发了一个哨子，只要发现可疑人物就吹响哨子求援，周围听到哨子的士兵必须无条件过去支援，敢怠慢者，杀。
因为这些政策，艾吉奥寸步难行，好多盗贼为了掩护他，都被威尼斯的士兵给杀了。
艾吉奥甚至求助于川上富江，希望她能出手干掉那个总督。
川上富江不答应：“我不是刺客，我答应马里奥的只是保住你的性命，你们刺客组织的事情，和我无关。”
面对油盐不进的川上富江，艾吉奥也是没辙了。
从1485年开始，艾吉奥就在走背字，做什么都不顺，但他毅力上佳，屡败屡战。
渐渐地，艾吉奥也舍弃了传统的刺客装扮，开始伪装自己，扮成不同的人，游走在威尼斯，和当地亲善圣殿骑士团的贵族杠到底。
三大工会的首领给予了艾吉奥最大的支持，双方互有胜负。