衡首先提出了三个不可预测的因素：天意、人心、气运。这三个因素涵盖了自然规律、民众情绪以及国家运势，它们的不确定性给国家治理带来了巨大的挑战。戴士衡认为，正是由于这些不确定性的存在，使得当时的统治者必须更加谨慎和明智地行事，以应对可能出现的各种危机。
接着，他列举了五个最令人担忧的问题：纪纲废弛、戎狄侵陵、根本动摇、武备疏略、府藏殚竭。这些问题触及了明朝当时的多个要害，从政治秩序的混乱，到外部势力的威胁，再到国家经济的困境，无不显示出国势的衰微。戴士衡的这份奏书，如同一面镜子，映照出了当时国家所面临的严峻现实。
然而，在所有的忧虑之中，戴士衡认为最为关键的，是“君心”的问题。他指出，皇帝的态度和行为直接影响着整个国家的命运。如果君主能够保持内心的正直与清明，勤于政务，减少私欲，与大臣们共同商讨国事，那么许多问题都可以得到有效的解决或缓解。他强调，皇帝应当经常亲临朝堂，与执政大臣讨论国家大事，以确保政策的正确性和施政的有效性。
戴士衡的这一系列建议，实际上是针对当时皇权过度集中、朝政日益腐败的现象提出的。他希望通过提高皇帝的自我约束能力和强化君臣之间的沟通，来改善国家的治理状况。遗憾的是，尽管戴士衡的奏疏充满了真知灼见，但当时的万历帝并未给予足够的重视，最终未能采纳其建议。
六、直面危机，勇揭弊政
在处理日本封贡事宜失败后，戴士衡展现出了他直面危机、勇揭弊政的坚定态度。他深刻认识到这一事件的严重性，并决定采取行动以纠正错误并防止未来的类似危机。
首先，戴士衡毫不犹豫地再次弹劾了石星、沈惟敬和杨方亨等官员，认为他们在处理日本封贡事务中负有不可推卸的责任。同时，他条列上呈了防备倭寇的八项建议，这些建议大多基于他对国家安全的深思熟虑和对倭寇威胁的准确判断。幸运的是，这些建议得到了朝廷的认真讨论，并多数得以实施，为国家的防御工作提供了有力的支持。
然而，戴士衡的直言不讳也引起了同僚们的不满和纷争。他接着弹劾了南京工部尚书叶梦熊、刑部侍郎吕坤、蓟辽总督孙幰和通政参议李宜春等官员，认为他们