包庇叛逆，直接关系到蔡毓荣的忠诚和操守。案件很快被提交到刑部审理。经过审讯，蔡毓荣的罪行被确认属实，根据当时的法律，他面临的是死刑判决。然而，康熙帝考虑到蔡毓荣在平定三藩之乱中的贡献，最终决定赦免他的死刑，改为籍没家产，并将他和他的儿子蔡琳一同发配到黑龙江戍边。
结语
蔡毓荣的一生充满了起伏，从早期的官场新星到后来的平叛英雄，再到最后的被贬官员，他的人生轨迹反映了当时社会的政治环境和个人命运的无常。尽管其晚年遭遇不幸，但蔡毓荣在治理云南期间所做出的努力及其提出的政策，仍然在历史上留下了深刻的印记，对于研究清朝初期的历史以及地方治理模式具有重要的参考价值。