同月，太平军攻下了武昌这座重镇，极大地鼓舞了士气。然而，他们并未在武昌久留，于2月上旬撤离武昌，顺长江东下，开始了新的征程。在撤离武昌的过程中，太平军的水师和陆军相互配合，展现出了高度的协同作战能力。
中旬时分，石达开率领的陆军攻破了安徽的重镇安庆，为太平军在东线的扩张奠定了基础。与此同时，罗大纲和秦日纲率领的水师也在鄂东的广济老鼠峡下巢湖大败清军，进一步巩固了太平军在水路上的优势。
到了3月19日，林凤祥、赖汉英、吉文元等将领率领的太平军成功攻破了南京，这座江南重镇终于落入了太平军之手。罗大纲和秦日纲率领的水师也紧随其后，共同保卫了这座已经占领的南京城。
五、攻破镇江
太平军定都南京（当时称天京）后，为了进一步扩大战果，决定派遣林凤祥、李开芳等人率领大军东下，随后折而北伐，目标是直取燕京（今北京）。在这场宏大的战略部署中，罗大纲率领的水军承担了重要的配合作战任务。
1853年3月31日，罗大纲与副将吴如孝接到了从水路攻取镇江的命令。镇江，这座位于长江与运河交汇处的古城，因其特殊的地理位置而成为了南北要冲和南京的东南门户，历来都是兵家必争之地。
面对如此重要的战略要地，罗大纲展现出了卓越的军事才能。他率领水军顺利攻占了镇江，并立即着手加强防御。他依托北固山的险要地势，傍着长江和运河，新筑了长达6里的城墙，并建造了6座炮台。同时，他还积极备战，广积资粮，为即将到来的清军反扑做好了充分的准备。
在接下来的五六月间，清军多次来犯，但都被罗大纲指挥的守军击败。由于战功卓着，罗大纲被晋升为殿左五检点。7月，罗大纲更是奇袭了北门外和东门外的清军敌营，使得清军“环城七营皆尽”，从而彻底稳定了镇江的局势。为此，罗大纲再次获得晋升，成为了 冬 官 正丞相。
在镇江期间，罗大纲不仅注重军事防御，还非常关注社会秩序的恢复和经济生活的正常化。他严格执行圣库制度，要求百工归衙，并建立了男馆和女馆来管理民众。同时，他还动员百姓量力捐献军需物资，并实行平买平卖的政策来保障民生。