病在伏见城逝世。临终前，秀吉深知自己的幼子丰臣秀赖（とよとみ ひでより）尚未成年，无法独自承担治理国家的重任，因此他精心安排了五大老辅佐秀赖，以确保丰臣政权能够延续。这五大老分别是德川家康、前田利家、宇喜多秀家、毛利辉元和上杉景胜。秀吉的这一安排旨在通过合议制度来平衡各方势力，尤其是抑制德川家康的崛起，以维护丰臣家的统治地位。
秀吉去世后，五大老和五奉行（石田三成、增田长盛、前田玄以、长束正家和浅野长政）迅速行动，确保国内局势的稳定。特别是石田三成，作为五奉行之首，负责处理秀吉去世后的各项事务。为了防止消息泄露引发混乱，石田三成和其他奉行们隐瞒了秀吉的死讯，继续指挥入侵朝鲜的日军与明朝议和，并逐步撤军。这场战争对日本造成了巨大的损失，不仅削弱了丰臣家的实力，还为德川家康的崛起埋下了伏笔。
尽管秀吉在临终前做了周密的安排，但五大老之间的权力平衡很快被打破。德川家康在五大老中最具影响力，他的势力逐渐增强，开始与其他四位老臣产生分歧。前田利家作为秀吉的忠实支持者，原本是制衡德川家康的关键人物，但他在庆长四年（1599年）去世，使得德川家康的势力更加无人能制。
随着前田利家的去世，丰臣家内部的权力斗争变得更加激烈。石田三成作为五奉行之首，开始与德川家康对立，双方各自笼络势力。石田三成主张维护丰臣家的统治，而德川家康则希望掌握更多权力。这种对立最终导致了两大阵营的形成：东军以德川家康为首，西军以毛利辉元为首。
庆长五年（1600年），两军在关原展开了一场决定性的战役，史称关原合战。在这场战役中，德川家康的东军凭借精良的准备和战略优势，最终击败了毛利辉元的西军。关原合战的胜利不仅巩固了德川家康的地位，也为他后来建立江户幕府奠定了基础。
关原合战后，德川家康的势力达到了顶峰。庆长八年（1603年），德川家康被任命为征夷大将军，正式建立了江户幕府。这一任命标志着丰臣家的统治正式结束，德川家康成为日本新的统治者。丰臣家的势力逐渐衰落，最终在庆长十九年（1614年）至庆长二十年（1615年）的大坂冬之阵和大坂夏之阵中被彻