绝迎北元使及在高丽百官上北元书签名，这些举动引起了亲元派权臣李仁任、池奫的不满。因此，郑梦周被流放至彦阳（今韩国蔚山广域市蔚州郡彦阳邑），两年后才获释回京。
三、历练四方
宣光元年（1377年，洪武十年）夏，东北面都元帅李成桂在南方剿倭，郑梦周亦以助战元帅的身份随行。这次行动不仅显示了郑梦周在军事上的才能，也进一步加深了他与李成桂的关系。九月，郑梦周被派往日本（北朝），解决倭寇问题。此前，使者罗兴儒在日本受到虐待，因此李仁任等权臣想借此机会让郑梦周也吃点苦头。然而，郑梦周凭借其出色的学识和外交手腕，与日本进行了友好的交流，成功说服九州探题今川贞世（源了俊）禁断倭寇。翌年七月，郑梦周回国，今川贞世派出僧人信弘率领69人前往高丽沿海捕捉倭寇，同时将尹明、安遇世等数百名高丽俘虏交由郑梦周带回。郑梦周因功被拜为正顺大夫、右散骑常侍、宝文阁提学、知制教。
洪武十二年（1379年）四月，郑梦周升迁为奉翊大夫、典工判书、进贤馆提学。闰五月，他又被任命为奉翊大夫、礼仪判书、艺文馆提学。十月，郑梦周再次升任典法判书、进贤馆提学。翌年三月，他调任版图判书，同年秋天，作为助战元帅，随李成桂在全罗道云峰大破倭寇。十一月，郑梦周被拜为密直提学、商议会议都监事、宝文阁提学、上护军。
洪武十四年（1381年）二月，郑梦周被授予“诚勤翊赞功臣”号，担任奉翊大夫、密直副使、商议会议都监事、宝文阁提学、同知春秋馆事、上护军。九月，他调任佥书密直司事。翌年四月，郑梦周被派往明朝，补齐高丽欠缴的金银贡物。然而，当他们走到辽东时，接到了明太祖以高丽“心不诚”为由要求高丽使者返回的圣旨。郑梦周只得返回高丽。不久，他又以请谥使的身份出使明朝，同样走到辽东就打道回府。洪武十六年（1383年）八月，郑梦周作为 助 战 元帅，随东北面都指挥使李成桂驱逐胡拔都。
洪武十七年（1384年）七月，郑梦周被任命为匡靖大夫、政堂文学，随后被派往明朝祝贺圣节。当时，明太祖对高丽五年岁贡不如约非常不满，一些高丽使臣因此被扣押甚至流放。因此，出使明朝被视为畏途，高丽臣