0辽东铁骑，这支精锐部队配备了三眼神铳。碧蹄馆一战，3000辽东铁骑（到战斗即将结束时增至9000）与强于己方的日军激战一昼夜，残酷的战斗持续到二十五日。
李如松和副将杨元先后率骑兵共2000前来救援，从日军侧翼发起猛攻。日军经过一昼夜激战，已成强弩之末，误认为明军主力发起总攻，遂撤回王京。此战，李如松报称明军阵亡二百六十四人，斩获日军首级一百六十七人。而据日本《立花家传》《武将列传》记载，日军阵亡的“武将”（在日本战国时期指军官和士官）包括：小野成幸、十时连久、池边永晟、安东幸贞、小川成重、安东常久、久野重胜、横山景义、桂五左卫门、内海鬼之丞、伽罗间弥兵卫、手岛狼之助、汤浅新右卫门、吉田太左卫门、波罗间乡左卫门，共计十五员之多，可见战况之惨烈。小早川隆景战后向丰臣秀吉汇报时声称打退了10万“明军铁骑”的进攻，实际上当时明军在朝总兵力不过才4万。
碧蹄馆大战是中日壬辰战争中明军的一次失利。但数量占优势的日军在此战后，不敢与明军 野 战 。而明军由于兵力有限，无法展开强攻，于是双方在汉城一线展开对峙，战局陷入僵局。
三月，李如松在得知汉城日军的军粮库在龙山大仓后，密令查大受和李如梅率敢死队700勇士深夜奇袭龙山大仓，将十三座大仓，数十万石粮食全部烧毁。军粮一失，日军陷入前所未有的困境。此后，朝鲜瘟疫流行，征发粮食不易，日军被迫与明朝达成停战协议。四月十八日，日军撤出汉城，五月二日，日军大部分退到了釜山一带，交还了俘虏的朝鲜王子。李如松于四月十九日开进汉城，五月十五日收复庆州。至此，除全罗和庆尚二道部分沿海地区为日军所占领外，“汉江以南千有余里，朝鲜故土奄然还定”。明军留下一万人驻守朝鲜，其余大部于七月底回国。
此役，东征大军在入朝参战的短短四个月的时间里，掠地千里，横扫半岛，收复平壤、开城、王京（汉城）三都，取得了辉煌的战绩。
战后，李如松回国述职，朝廷论功，加其为太子太保，中军都督府左都督。万历二十五年（1597年），辽东总兵官一职空缺，廷议再三推举人选，神宗特出中旨用李如松为辽东总兵官。言官争相劝阻