大业九年八月，炀帝驾幸高阳。
杨广闻说杨玄感叛军已被扑灭，终于放下心事，因使大理卿郑善果、御史大夫裴蕴、刑部侍郎骨仪与留守樊子盖四人，推鞫杨玄感余党。
四人领旨称诺，隋帝复对裴蕴嘱道：杨玄感一呼而从者十万，朕益知天下人不欲其多，多即相聚为盗耳。若不尽加诛戮，无以惩后，卿须识之。
因此裴蕴仰承帝意，皆以峻法治之。此事之后，炀帝见中原皆反，便启驾往幸江都。
隋帝在江都坐犹未稳，黄门入报：今有山东章丘杜伏威、临济辅公袥率众起事，转向淮南，会合苗海潮、赵破陈等部，自称将军，声势大盛，进逼江都。
炀帝闻而大怒，便于江都调派兵马，使叶万绪为将，命限期扑灭各地叛军。
叶万绪奉旨，率兵进攻刘元进、朱燮、管崇等部，逼其退保黄山，然后围剿。刘元进、朱燮逃跑，管崇被擒。叶万绪斩杀管崇，及其将卒五千余人，收其部众子女三万余口。
炀帝复派江都丞王世充，发淮南兵数万人进讨刘元进。
王世充渡江进剿，频战皆捷，刘元进、朱燮败死于吴郡，余众或降或散。王世充召降者焚香为誓，约不杀降，哄骗义军余众归降之后，全部坑于黄亭涧，死者三万余人。
因此刘元进余党复又相聚为乱，官军遂不能讨，以至隋亡。
大业十年，春二月，辛未。隋炀帝不顾天下盗贼蜂起，再诏百僚，议伐高丽。由是廷议数日，群臣无敢言者。戊子日，下诏复征天下之兵，百道俱进。
九日之后，扶风贼帅唐弼便又起兵，自称唐王，拥立李弘芝为天子，拥众十万。
三月，壬子，炀帝行幸涿郡，士卒在道亡者相继。癸亥日到至临渝宫，郊祭黄帝，斩叛逃军士衅鼓，然而逃亡者更众，不能遏止。
夏四月，榆林太守董纯与彭城贼帅张大虎战于昌虑，大破贼师，斩首万余。
五月，庚申日，延安贼帅刘迦论自称皇王，建号大世，拥众十万。因与稽胡里应外合，侵掠地方。炀帝时至北平，诏命左骁卫大将军屈突通为关内讨捕大使，发兵进击刘迦论。
两军战于上郡，屈突通斩获刘迦论，及其部众首级万余，俘获男女数万人返师