个时候，邻居家发生了爆炸，那个被叫做疯狂博士的大叔出现在他的面前。
聊了一会儿，疯狂博士终于确信了鹿丸的身份。
进到自己家里，
拿出自己小时候衣服换上时，
变小的鹿丸遇到了找来的奈奈，
被疯狂博士好一顿安慰，
让小鹿丸住进奈奈的家里。
原来奈奈的爸爸也是个侦探，就是对啥事儿都不太感兴趣……
变小的鹿丸化名为江户川悠住进了奈奈家。
接下来的日子，
假小孩悠和奈奈还有那个有点不靠谱的大叔一起经历了好多案件，
在又经历了一次银行抢劫案后，
悠终于发现那是个很庞大的组织，
组织里的人都用酒来做代号，
然后在告诉了自己真名后，
就眼睁睁地看着那个叫春野幽芷的温柔大姐姐死在了自己怀里……
这次案件结束后，
心情平复下来的鹿丸正盼着早点再和那个组织碰面呢，
一个同样变小的女孩出现在了他的生活中，
小鹿丸可不同意这个女孩的做法，
因为就是这个女孩制造了那种能杀人的毒药，
两人就这么吵了一架，
疯狂博士这时候说话了：
“既然灵樱是制造这种药的人，那肯定能制造出解药啊。”
山中灵樱这时候也想起来当初不小心把一些资料寄到了姐姐学校的一个教授那儿……
三个人急急忙忙地赶过去，
结果这个教授已经被人给杀了，
鹿丸解决了这个案件，
灵樱却扑到鹿丸怀里哭着说她为什么不救自己的姐姐，
鹿丸这才知道灵樱的姐姐就是当初那个抢劫案的春野幽芷，
这可把鹿丸给自责坏了，最后发誓一定会好好保护灵樱。
不过实际上呢，
鹿丸好像并没有遵守这个诺言，
总是差点让灵樱陷入危险之中，
而且随着越来越多的人知道悠就是鹿丸变小的，
鹿丸反倒是越来