机训练出一批航海人才和造船人才，培养出一支现成的海上运输力量，运送到东江镇和朝鲜的物资和军器，也可以直接走海运，能更加迅速。以后把这支海运力量转训成海上作战的军队，也很容易。就可以逐渐摆脱对郑芝龙的依赖。
钱谦益还提出设想，他以前看过李之藻和利玛窦绘制的《坤舆万国全图》，近期又看到了李之藻指导工作制作的地球仪，知道海外有大量地盘可以居住，将来海运规模不断扩大，以后如果明朝内地人口太多，也可以设法从海路迁徙到海外各地。
如果明朝发生灾荒、流寇作乱，全部杀掉太残忍，放掉也不行，这些人已经习惯抢掠，难以安居。可以招安之后，把这些人放逐到海外那些地盘，可以断绝乱源，又使这些人有生路，还能散播中国人于海外，别开天地，也能一举多得。
这个建议很有穿越者思维，崇祯自然非常赞赏，全力支持。批复南方由海运逐步代替漕运的事情，就由钱谦益主管。汪汝淳以前也在海上经商多年，对海运也有相当的经验，就任命他为这件事的提督，原先的漕运士兵，也不能让他们失业，这也不难，河运和海运都属于航运，这些人稍加训练，也能用在海运中。
按原计划钱谦益打开了南方战时新政的局面以后，就该回北京了，不过他在南方开展了很多新的工作，兴办海运、开办官方钱庄、推进人口普查、制定新版黄册编写规范，短时间无法从江南巡抚的位置上卸任。
阎应元则领受到了新任务，去浙东义乌，建立一支兵力五万人的新版戚家军，要求是按戚继光的练兵方法，训练出一支战斗力不低于当年戚继光亲自率领的戚家军的军队。同时崇祯也拨出了两百万军饷运去了四川石柱交给秦良玉，让她把白杆兵也扩充到五万。这是参加浑河之战的两支王牌军，只要兵力足够，战斗力肯定胜过后金。
得知了这个消息，在阎应元临走前，沈飞找到了他，跟他说了一些军事上的想法，戚继光练兵之精冠绝天下，经常打出几十比一的交换比，不过其实每一仗都保持对敌军的兵力优势，武器装备也优于敌军，无论是南方还是北方，都强调武器“五件当他一件”。
就是兵贵精也贵多，“以少胜多”是一些人喜欢听的故事，不过却是侥幸行险，真打仗必须保持三