余子航在帮助商朝后裔反抗西周的过程中遇到了诸多困难，主要包括以下几个方面：
1 内部问题：
- 人心不齐：商朝后裔虽然有着复国的强烈愿望，但并非所有人都能坚定地团结在一起。一些人在商朝灭亡后经历了颠沛流离的生活，对复国之事心存疑虑，担心再次失败会带来更严重的后果。他们对余子航这个突然出现的陌生人也不完全信任，在是否听从余子航的建议和领导上存在分歧。例如，在最初制定军事训练和作战计划时，就有部分人持观望态度，不愿意积极参与，这使得团队的凝聚力和执行力大打折扣。
- 物资匮乏：商朝后裔在西周的统治下，生活困苦，资源匮乏。他们缺乏足够的武器、粮食、衣物等基本物资。制造武器需要的金属材料短缺，粮食储备也不足以支撑长期的战争，这给余子航的军事行动带来了极大的阻碍。为了获取物资，余子航四处寻找可以利用的资源，甚至冒险去偷袭西周的一些小型据点来抢夺物资，但这也只是杯水车薪。
- 缺乏军事人才：商朝灭亡后，很多有经验、有能力的将领或战死或被西周俘虏、杀害，导致商朝后裔中缺乏优秀的军事指挥人才。余子航虽然有一定的战略头脑，但毕竟不是专业的将领，在指挥大规模战斗时经验不足。而且，由于缺乏军事人才，在训练士兵、制定战术等方面进展缓慢，士兵们的战斗素质提升有限，难以与西周的正规军相抗衡。
2 外部压力：
- 西周军队的强大：西周经过多年的发展，拥有强大的军事力量。其军队训练有素、装备精良，在数量和质量上都远远超过商朝后裔的反抗力量。西周的将领们也大多有着丰富的作战经验，熟悉各种战术和战略。例如，在余子航等人袭击西周的后勤补给线后，西周朝廷迅速派出了精锐部队进行围剿，给商朝后裔的反抗力量带来了巨大的压力。
- 西周的政治影响力：西周建立后，通过分封诸侯等方式，巩固了自己的统治，在政治上具有很强的影响力。许多诸侯国都与西周保持着密切的联系，对商朝后裔的反抗持反对态度。这使得商朝后裔在反抗过程中，很难得到其他势力的支持和帮助。余子航曾试图联络一些对西周不满的势力，但由于西周的政治影响力太