就这样，又过了五年，所有孩子都在吃、喝、睡、修炼、学习这样的循环中度过漫漫时光。
在这一天，也就是六元纪803年3月20日，一场灾难突然降临。
红色的晶石在不停地闪烁、刺耳的噪音在研究院每一个角落回响，巨大的地下实验室在剧烈颤抖、坚实的墙壁被撕裂开一条条巨大的裂缝，千号恐惧地抱着零号，两个人蜷缩在宛如末日来临的房间角落，听到外面研究人员的逐渐远去的呼喊大叫，只能静静等待着命运的到来。
这次，命运眷顾了她们两个小女孩，她们成功活了下来，除了外面的千号受了点擦伤，两人灰头土脸之外，没有其他伤亡。
两个人被一群身穿六道院专属制服的人救出来，放在担架上，看着脚下巨大的坑洞，形形色色的外人，花花绿绿的世界，以及穿破烟雾，照耀在她们脸上的第一缕阳光，她们难以相信眼前的一切，难以相信这个真实的世界。
在她们看来，只有那间容纳了自己一群人的小屋子，才是现实世界，眼前的一切，即使在梦里，她们也没有梦到过。
之后，千号精神恍惚，而零号则是直接崩溃了，她无法接受死里逃生之后突然降临的美好世界：温暖的阳光、甘甜的溪水、飘香的花朵、美味的食物……这些不存在她的世界里。
在她的世界里，只有千号和黑暗的小屋。
之后，伏天看到了千号是怎么一点点接受现实，一点点打起精神，一点点鼓励零号的，最终，零号被她劝服，终于打开自己封闭的内心，一点点接受这个世界，学习做一个正常人。
而千号看起来接受得很快，她很聪明，不出半年就言谈举止就恢复成一个正常人——至少看起来是这样的。
但伏天在她的记忆里，能清楚地看到有多少次她从睡梦中惊醒，疯言疯语；有多少次她历经挫折，无声哭泣；有多少次她感受到世间美好，却掩面痛苦，接近崩溃。
她们所有人心里的世界都被摧毁了，而零号有她帮助，她只能靠自己。
在这场危机中，能挺过来的人逐渐恢复正常，进入六道学院学习，和常人无异，而那些没能挺过来的人大多精神失常，有些甚至因此无法控制自己，导致血脉冲突，暴毙而亡。