林念慈和沈玉陷入了两难的境地。接受富商的资助，虽然能够解决眼前的资金问题，但可能会影响医馆的独立性和公正性；拒绝富商的资助，医馆则可能面临倒闭的风险。
经过一番深思熟虑，林念慈和沈玉决定与富商进行谈判。他们向富商阐述了“济世医馆”的宗旨和理念，希望能够在不违背医馆原则的前提下，达成合作。富商被他们的诚意和坚定的信念所打动，最终同意了他们的条件。
在富商的资助下，“济世医馆”解决了资金问题，重新购置了优质的药材和先进的医疗设备。同时，林念慈和沈玉将收集到的证据呈交给了官府，揭露了孙鹤年等人的阴谋。官府经过调查，证实了他们的罪行，对孙鹤年等人进行了严厉的惩罚。