衡理念和对宇宙的哲学思考。
然而，就在双方合作顺利展开时，一股暗流在暗中涌动。一个隐藏在联盟内部的神秘组织开始活跃起来。这个组织由一些对联盟现有秩序不满的极端分子组成，他们认为联盟与其他种族的合作是对自身种族的背叛，古老文明技术应该被用来建立一个以联盟为绝对统治的宇宙帝国。
这个神秘组织开始在联盟内部散布谣言，制造混乱。他们利用一些民众对未知风险的恐惧心理，煽动对古老文明技术试验和对外合作的反对情绪。在一些星球上，出现了小规模的抗议活动，要求停止与泽尔星团的合作，以及终止古老文明技术的试验。
艾莉丝和暗影主宰敏锐地察觉到了这股暗流的威胁。他们一方面加强了对民众的宣传和教育，解释合作与试验的重要性和安全性；另一方面，命令情报部门全力调查神秘组织的背景和活动轨迹。
情报部门经过艰苦的调查，终于揭开了神秘组织的面纱。原来，这个组织的核心成员中有一部分是曾经参与神秘组织袭击事件的残余势力，他们在被击败后潜伏下来，等待时机卷土重来。他们与一些对联盟心怀怨恨的势力勾结在一起，企图破坏联盟的稳定。
“绝不能让他们的阴谋得逞。”暗影主宰下令对神秘组织展开全面打击。联盟的执法部队迅速行动，在各个星球上展开搜捕行动。经过一番激烈的较量，神秘组织的大部分成员被抓获，但仍有一些核心成员逃脱，躲进了宇宙深处。
在解决了内部危机后，联盟将注意力重新放回古老文明技术试验和与泽尔星团的合作上。在荒芜星系的技术试验取得了初步成功，能量转化技术的应用并没有引发严重的宇宙环境问题，但仍需要长期的监测和进一步的优化。
与泽尔星团的合作也进入了新的阶段。双方决定共同建立一个联合科研基地，开展跨种族的科学研究。这个科研基地将汇聚联盟和泽尔星团的顶尖科学家，共同探索宇宙的奥秘，研究如何更好地利用资源，以及应对可能出现的宇宙威胁。
然而，宇宙的变化总是让人始料未及。就在联合科研基地建设过程中，一种神秘的宇宙现象出现在泽尔星团附近。一片巨大的能量云团正在逐渐靠近泽尔星团，这片云团蕴含着强大的能量波动，对泽尔星