穿了整个石山山体时，就被称为“穿洞”了。桂林北面的灵川就是这样形成和得名的。
穿洞
当脚洞上升之后，高出地下水面时，穿过石峰的脚洞，就叫做“穿洞”。这是由于地壳上升了，或者地下水面下降了。从前的脚洞就成为没有流水、积水的干涸洞穴，洞底也高出平原地面，变成为于半山上的洞穴，由于洞穴穿过石山，故名“穿洞”。穿洞可以由于不断侵蚀、崩塌，变成一个半山上的洞穴，有如窗口，这种奇异的地形，每成为当地风景区，如阳朔的月亮山，即因穿洞有如半月形状得名，故又名明月洞。
此外，桂林穿山的月岩，坪山的穿岩都有象明月高悬天空美景，成为名胜。它们都是上升了的脚洞所成。即在中更新世时（60多万年前），这里是一条地下河所在。当时地面即今天的40～60米比高的阶地面。目前桂林峰林石山中最好的穿洞，却不呈月亮山形态，而是保存良好的脚洞地形，例如平坦的洞顶，边槽有多层，石锅、石钟的发育，平坦而有地下河堆积的洞底等。
穿洞毕竟和脚洞不同，因为地下河消失了，洞穴中水流向下流失了。于是无水的洞穴给石灰华沉积带来良好的保存环境，钟乳石、石笋、石柱、石幕、灰华阶地（包括灰华田）最为发育，还有平缓洞底可发育出深深陷落的落水洞，被称为“无底洞”。洞口及洞顶每因长期受侵蚀、溶蚀而崩塌，使洞口高而广大，崩石塞道，洞内大厅又可因崩落而显得特别高大，破坏平坦的洞顶地形。例如桂林芦笛岩就是以各种石钟乳出名，游览道路要靠凿开钟乳石林来开辟。
桂林七星岩以四十五个洞连成，主洞长达814米，贯穿着八大厅堂，五个出口；全部洞穴长达3公里，分为三层，最下一层仍为脚洞；中层大洞厅堂高27米，宽48米，由二层脚洞崩陷合成；有边槽（称白石天篷），脚下听到地下洞穴的“空谷传声”。中心部分较低，即大教场处，为古地下湖所在。落水洞分别被命名为“无底深潭”、“癞子潭”、“双狮守龙潭”等。在茅茅头石山（即光明山），除芦笛岩外，还有大岩（长达875米，唐代僧人墨迹亦已被钙膜保护起来，墨迹如新）、飞丝岩、穿岩等四个穿洞贯穿，这种穿洞是战时避难地点，因为洞底平坦，厅堂广大，支洞众多，战时工厂