船舱内，一个身影隐匿在阴影之中，声音低沉而又带着几分得意：“过去那三股力量刚好维持平衡，其中一个被我拿走了，崩溃的部分埋起来。”
与此同时，飞船的探测系统发出提示：“疑似闪电鸟的生命体在向火之岛移动中。”
另一边，大木博士的研究室里，灯光通明。大木博士正专注地盯着屏幕上的信息，眉头微微皱起。
一旁的花子也凑了过来，看到屏幕上关于橘子群岛的异常数据，不禁说道：“橘子群岛，正好是小智他们现在要去的地方。”大木博士还没来得及回应，电话铃声突兀地响起。
他迅速接起电话：“我是大木博士。”
电话那头传来内木博士焦急的声音：“我是橘子群岛的内木博士，橘子群岛的神奇宝贝们都发生了异变了！”大木博士神色一凛，意识到事情的严重性。
小智这边，他们乘坐的船只在波涛汹涌的大海上颠簸前行。原本阴沉的天空渐渐放晴，阳光洒在海面上，波光粼粼。然而，大海却依旧动荡不安，海浪不断拍打着船身。
小美一脸疑惑地说道：“为什么大海还是动荡不安呢？”摇晃的船只艰难地来到了一个小岛上。
皮卡丘一踏上小岛，就兴奋地往高处跑去。小智见状，急忙喊道：“皮卡丘，你要去哪里？”说着，便和莎莉娜一起跟着皮卡丘跑了过去。
小霞等人在后面乘船也找到了小美的船，他们紧跟在小智一行人的身后。
小智和莎莉娜一路追赶，来到了一座古老而神秘的庙前。皮卡丘停了下来，用小爪子指着庙内的一处地方。
莎莉娜顺着皮卡丘指的方向看去，惊喜地说道：“这个就是宝藏吧？”
小智仔细打量着，肯定地回答：“应该是没错了。”说着，便伸手拿起了宝藏，和莎莉娜一起走出了石庙。
可就在这时，熟悉的笑声从背后传来。“是自投罗网的皮卡丘喵。”
喵喵的声音响起，火箭队三人组出现在他们面前。
小智无奈地叹了口气：“火箭队，我很忙，你们没看到天气变得很奇怪吗。”
武藏双手叉腰，毫不理会小智的话：“你说的没错，那就趁天气还没有变糟，赶快把那边那只皮卡