主动退兵收场，但大明的形势却并未因为敌人撤退而好转，京畿及山东有很多地方都变成了无人区，社会生产完全停滞，所受损的国力也无法在短时间内得到迅速恢复。
而因为这场战争背井离乡变成难民的人口，要比清军掳走的还要更多。由于在冬季逃难过程中缺衣少食，很多人甚至都没能撑到战争结束。按照最为保守的估计，大明在这场战事中损失的人口也在四十万以上。
此外难民潮所致之处，很多地方都根本无法负担赈济难民所需的粮食物资，这也导致了各种次生灾害的爆发。仅在济南府周边的东昌府、兖州府、青州府等地，就发生了大大小小数十起的流民暴乱，甚至出现了上千流民聚集起来攻打县城的闹剧。
这或许有来自中原地区的农民军势力在暗中使坏，或许是侥幸存活下来的乱军想趁火打劫，但客观上已经是让这些地区陷入了第二波的混乱。而官府也无从判断哪些人是真难民，哪些人是潜伏其中的乱民，一旦发现不对就只能用粗暴的方式来杜绝隐患，但这也往往导致了更为激烈的冲突。
这么大的乱子，朝廷肯定要在时候追究责任，但这个锅肯定不能由最高决策者来背，那就只能清算各级地方官府抗清不力的罪责了。
原本这个背锅的人选应当是制定应对策略的兵部尚书杨嗣昌，但这位杨大人又岂肯自行背锅，便上书启奏了地方各级官府和明军的五大罪状。
一是守边失机，二是残破城邑，三是失陷藩封，四是失亡主帅，五是拥兵观望。于是经过他的推脱甩锅操作，崇祯下旨处理了一大批替罪羊。
这其中包括了蓟镇总监中官郑希诏，分监中官孙茂霖，顺天巡抚陈祖苞，保定巡抚张其平，蓟镇总兵吴国俊、陈国威，山东巡抚倪宠，援剿总兵祖宽、李重镇，及其副将以下至州县有司，包括那位一心想在德州设立防线阻击清军的山东巡抚颜继祖，共计三十六名官员以死罪论处。至于被贬被削的官员，数目更是几倍于此，可谓是一场官场巨震。
唯一值得庆幸的是，原本历史上在这场战事中不幸战死的兵部侍郎卢象升，倒是侥幸活了下来。这客观上也得益于海汉早先向其提供的一些武器装备，其中的二十门火炮帮助卢象升在最后关头守住了贾庄，击退了清军的围攻。只是