撵着荷兰人屁股一路追到码头的并不止步兵而已，小镇上仅有的几匹骡马也被临时征调，用来牵引民团的几门轻型火炮。虽然畜力自行火炮的速度比较慢，不过还是赶上了最后一波，对着正在匆匆驶离码头的荷兰帆船轰了几轮。但小口径火炮对帆船船身所能造成的伤害极其有限，威慑效果要远大于实际战果。
不过追击也并不是一无所获，荷兰人前一天从船上卸下来的各种物资、装备，绝大部分都没能来得及在仓惶逃跑的时候带走，在岸边堆成了一座小山。此外还有数十名荷兰雇佣兵和水手在最后时刻没能及时撤离到船上，在民团军的包围之下无奈地变成了俘虏。
由于安不纳岛本地已经没有可以用于作战的大型海船，穆夏柏也只能很无奈地看着荷兰人的船队以十分缓慢的速度离开港口。值得庆幸的是，不管这支船队是选择南下返回还是北上去台湾大员港，穆夏柏都可以确定他们在短时间内不会再回到这里来了，驻岛守军也得以有一段休整时间，并根据这次的交战状况，对本地的防御策略作出一些调整。
由于此次作战的交战区域面积比较大，战后对于战果的清点工作也较为麻烦，穆夏柏动用了数百人，花了一天一夜才完成。
此次交战过程虽然仅仅只有两天一夜，但战斗强度的确已经算得上近期少有，仅火炮就发射了六百余发，火药使用量超过两千斤。算上临时征召的民兵在内，海汉一方实际参战人员超过了六百人——这个数字其实已经大大超过了荷兰人，只是对手一直认为是武器性能吃亏导致战局不利，在最后时刻才意识到自己在兵力上也同样处于劣势。
此次交战中海汉一方牺牲十八人，伤二十二人，在近两年海汉的对外军事行动中算得上是伤亡最为惨重的一次。其中在第一天的港口炮台争夺战中就牺牲了十六人，这个责任其实有很大一部分都得归咎于军方前期所制定的防御策略。不过好在穆夏柏临场应变的能力也还不错，及时调整了作战策略，让顶在港口一线的作战人员全部后撤，选择了更加有利的防御位置来与对手进行正面交锋。而这个改变也让海汉一举转被动为主动，在接下来的战斗中收获了不错的战果。
根据战后的统计，荷兰一方在这次为期两天的遭遇战中共计战死一百七十七人，这个