最终没能活捉郑芝虎的确让许甲齐感到有点失望，不过更让他感到的惋惜的是这个功劳竟然被水师抢了去，于是也更加后悔早先没有听从钱天敦的建议，自己带兵来攻打十八芝的营寨，否则其实还是有机会把郑芝虎留在岸上，由自己来拿下这份大功。
钱天敦此时想的却跟他有所不同，这次作战的主要目标之一就是拿下郑芝虎，现在这个目的已经实现，而之后福建海峡地区的局势将会如何发展，也需要好好思考一番了。
郑芝虎之死毫无疑问将彻底撕裂福建官府与十八芝之间的关系，如果说在此之前双方或许还存在着一些台面之下的交易和默契，那么从此刻开始仇恨值已经上升到一个无法弥合的高度。就算郑芝龙心里有别的想法，他也不得不为了维护自己“有情有义”的头领形象，从今以后与福建官府死磕到底。而对于一度很担心福建官府态度的海汉来说，倒是一举解决了后顾之忧，不需再担心福建官府对十八芝的态度出现反复。
这次在南日岛对荷兰人的打击也算是另一个收获，一方面通过交手大致了解了荷兰人的实力和作战方式，另一方面也为海汉接下来准备用来对付他们的一些手段提供了极好的理由。前几天的海战之后，有四艘荷兰武装帆船未能成功脱离战场，全部被明军水师俘获，经过清点之后，这四艘帆船上的船员共计472人，其中有107人在交战中战死或落水失踪，剩下的人员全部被俘——这也是荷兰东印度公司进入远东以来在军事行动中被俘人数最多的一次。
当然了，这三百多名俘虏也并非都是荷兰人，大多数人分别来自荷兰在全球各地的殖民地，真正的荷兰人不过才五十多人而已。这批俘虏目前已经被押送到中左所城里关押起来，近期大概不会有脱身的可能了。按照海汉的提议，福建官府已经准备派人去大员向荷兰人提出交涉，并且会索要一笔战俘的赎身费。
如果荷兰人想要从福建官府手里索回这些战俘，那么就得向福建官府支付五万两白银，作为此次多管闲事的代价。此外福建官府还将代海汉向荷兰人索要五万两白银的“战争赔偿”，理由是荷兰武装帆船在交战中致死致伤多名海汉船员，并且造成了海汉船只的损毁。除此之外，福建官府还将要求东印度公司必须承诺今后不以任何形式参与或