到这样的程度已经有了一定的预计，但心里难免都还存有一丝侥幸，认为海汉的动作或许不会这么快。当这天真正来到的时候，十八芝上上下下还是陷入到了难以抑制的恐慌之中。
在消息传开的当天晚上，就有三艘船无缘无故地从马公港消失了。虽然这些人没有在离开前留下只言片语，但留下的人却在纷纷传说离开者就是为了逃避海汉人即将发动的进攻。十八芝的头目们并没有及时对这样的传闻进行管制，然而过了一夜之后，马公港又少了几条船，而这次偷偷溜走的家伙不但带走了船，还打着郑芝豹的名号从岛上的粮仓提走了三千斤粮食。
郑芝龙得知之后自然是大发雷霆，一面派船追捕逃走的属下，一面将郑芝豹叫到书房狠狠地训斥了一通。训完自己兄弟之后，郑芝龙倒也没忘了亡羊补牢，下令澎湖所有港口码头进行管制，没有郑芝龙的手令，任何人不得驾乘百料以上的海船出航。
郑芝龙现在的处境的确十分艰难，虽然已经与各个大头目商定了撤往海外，但撤退计划一直未能完全定下来。毫无疑问，对岸如果知道十八芝选择撤离，很有可能会衔尾而至，趁十八芝撤退期间发动进攻。而十八芝在澎湖有上万属下，加上家属足足有三万人上下，并不是一朝一夕就能全部撤走的。留下来垫后的，很可能就会被对岸的大军给堵在澎湖。
为了能够早日定下撤退的计划，郑芝龙不得不自己先站出来，从他的直属人马中抽出一千人负责垫后，而其他各家头目则通过抽签的形式，抽出四家来再凑一千人，总计两千人留在澎湖主岛上，作为最后一批撤离的人员。同时郑芝龙也特地派了数艘快船前往漳泉附近海域，监视联军的动向。
而海峡对面的联军自然也没有闲着，加紧了在海峡内的巡航力度，双方在四月中旬的短短数天之中，就在海上交手了好几次。不过十八芝一方明显吃亏多一些，因为联军派出来巡航的船只几乎都装备了产自海汉的火炮，而十八芝的侦察船为求轻快，船上基本不会配备任何重武器，双方一旦接近到一定的距离，联军一方的火炮就会让十八芝的海船尝到只能挨打不能还手的滋味。
到四月下旬，十八芝的船已经不敢在白天靠近金门岛附近海域进行抵近侦察，只能选择入夜之后才从比较远的地方驶到近处