问题不大，但要吸纳移民、屯驻海军，就还需要在本地另行建设港口码头。
5月5日，眼见大势已定，海汉民团开始逐步撤离澎湖。石迪文的舰队首先出发，护送一个营的陆军踏上了返回三亚的航程。一天之后罗杰的舰队也离港出发，与其同行的是这次特地从海南岛各地集中起来的炮兵营。不过炮兵营这次并没有在澎湖战役中捞到什么油水，上岛之后根本就没有再爆发过大规模的交火，炮兵们只是在攻打几处据点的时候出场刷了一下存在感，所获得的战功远远不及海军的同行。
5月9日，颜楚杰和王汤姆也率部离开了澎湖返回三亚。与其一同南下的除了民团陆军之外，还有福建军方派往三亚接受为期三个月军训的新一批基层军官，同时这也是许心素与海汉合作以来派出的第六批留学军官。
这批军官几乎全部是来自福建水师，他们到三亚期间除了学习海汉海军的各种战术之外，还有一个很重要的任务就是接收新近下水的两艘“探索级”战船，这也是海汉为福建军方定制的首批八艘战船中的最后两艘。不过胜利港造船厂倒不用担心担心没了订单，因为在澎湖战役结束之后，许心素就又向海汉下了八艘战船的订单。许心素如此的豪气，主要还是因为澎湖战役的迅速结束让他省下来一大笔的预算，而这笔钱也正好就可以用来扩充福建水师，逐步淘汰那些早就已经过时的老式舰船。
而钱天敦则将驻守在新的据点，在今后的一段时间内，澎湖的军政大权都将由他一人掌控。起码到等到澎湖商港初具规模之后，大本营才会派人过来接管民事方面的事务。
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