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原来就在前几年，长崎所在的九州岛上爆发了一场大起义，起义最早是在岛原地区爆发的，所以叫作岛原之乱，后来扩展到了天草半岛，所以也叫天草之乱。
这场起义与九州诸藩持续数年的饥荒有关，也跟葡萄牙人在岛上到处传播天主教有关。
但是早就对葡萄牙人到处传播天主教不满，并且准备奉行锁国政策的德川幕府，将主要的原因归咎到了葡萄牙人的妖言惑众之上。
因为参与岛原、天草之乱的很多人，都是当时的备受欺压的天主教徒，即倭奴国所谓的切利支丹教徒。
经过几年的残酷镇压，岛原、天草之乱最终平息。
随后德川幕府调转矛头，开始针对岛原天草之乱的始作俑者葡萄牙人及其传教士，最后在荷兰人的支持下，驱逐了葡萄牙人，处死了所有不肯悔改的切利支丹教徒。
而在这个过程中，因为共同针对葡萄牙人的原因，荷兰人得到了德川幕府的垂青。
在德川幕府的锁国令发布之后，荷兰人遂垄断了西夷各国与倭奴国的贸易权力。
荷兰人之所以得到德川幕府的信任，是因为荷兰东印度公司与葡萄牙人、西班牙人都一样，他们主要是唯利是图的商人，以谋利为主，并不传教。
而且荷兰人所信的教，也不是天主教，而是新教里的一种偏门教派，并不把传教当成是比做生意赚钱还重要的使命。
但是，自认为吃了葡萄牙人大亏的德川幕府，对所有的洋夷都充满了警惕，对荷兰红毛夷同样并不放心。
也因此，荷兰红毛夷所拿到的洋夷之中唯一的独家贸易权，其实是用许多条件换取来的。
其中有一个，就是来到倭奴国的荷兰红毛商船，入港停靠之前，必须拆卸船上的大炮，集中存放到岸上，等到船只离港返航的时候才能重新拿回它们。
荷兰人为了拿下独家贸易权，一方面支持德川幕府锁国，不与其他西夷贸易，一边答应了这个苛刻的条件。
这样一来，就导致荷兰东印度公司的武装商船一进入长崎港停泊，就得炮和船分离。
等到这次长崎港因为鼠疫而彻底陷入混乱，成了一座死城鬼域之后，被隔绝在长崎港前出岛上留守的荷兰红