大乱，孔耿等人先后渡海逃跑，带残兵败将投奔后金，叛乱随即被明军镇压。
孔耿渡海而逃，耿仲明原本不想投奔后金，因为他本来就是后金逃将，他还想投降朝廷，便上书修筑南关、为朝廷收复金州以赎罪。
但他早前在皮岛把黄龙得罪得太狠，黄龙只想杀他不想抚他，除了投后金无处可去。
因为这一立场，天佑军里孔有德部下许多被迫投降后金的士兵，更愿意跟着耿仲明，以至于跟孔有德产生裂痕。
黄台吉也不信任耿仲明，所以打仗都得把他带走，让孔有德守辽阳。
尚可喜则是另一种出身，跟孔有德、耿仲明在内的天佑军都有仇。
他是出生在海州的世袭军人，父亲和兄长是随毛文龙孤军入辽南的一百九十七勇士。
根正苗红的忠烈将门。
当年毛文龙孤军入辽南，尚可喜也投军加入明军水师，次年皮岛开镇，他就去皮岛寻父，团聚没多久父亲和兄长就都在与后金交战时阵亡。
他出身明军序列，又满门忠烈，跟沈世魁、孔有德那些辽南难民头目不一样，因此在明廷任命黄龙为总兵官，耿仲明的弟弟耿仲裕折腾黄龙、沈世魁试图夺权时，尚可喜坚定地站在黄龙这边，带兵将其救出。
他也成了黄龙的心腹，转头镇压山东叛乱，率领水师在海上大败孔有德、耿仲明。
只不过运气不好，作为靠山的黄龙转头战死了。
尚可喜的父亲是东江元老，辽南的大英雄，但毕竟大英雄死得早。
东江镇的历史是个圆圈，从毛文龙开始，势力膨胀形同外藩，朝廷鞭长莫及，控制力低到极点。
明廷试图控制，杀毛文龙，分陈继盛、刘兴祚等人之权，朝廷的权力回来了，对东江镇拥有了控制力，接纳辽民登陆山东。
随后皮岛为争权夺利展开大战，外溢出了李九成、孔有德、耿仲明，在山东掀起巨大叛乱。
直到黄龙死去，辽南难民出身的沈世魁成为皮岛总镇，朝廷鞭长莫及，控制力再度低到极点。
而尚可喜是坚定站在朝廷这边的人，早前镇压叛乱，打的都是东江出身的将领和士兵，没了靠山，东江镇不仅没人愿意接纳他，不少人还恨不得除之